手术室净化系统在调整完毕后，应将调节阀门加以固定，运行中不得随意改动。当一个系统中连接有几个排气点时，若某一排气点的工艺设备停止运行，该排气罩也不宜关闭，以免改变其它排气罩的排风量。
一般除尘装置应在净化设备启动之前启动，在手术室净化设备停止运行5分钟后再关闭，以防止粉尘等物质在设备和风管内沉积。为防止电动机启动时过载，特别是对于高温烟气净化系统，可调节总阀门开度，在减小风量情况下启动。
根据国家对手术室湿度的新要求显示，相对湿度达到50%时，细菌在空气中浮游10~12min左右就会死去；而当相对湿度远远大于50%时，空气中浮游的细菌极有可能会存活24h以上甚至更久；当相对湿度远远小于50%时，空气中浮游的细菌存活时间同样可达到24h以上，甚至更久。只有当相对湿度太高的时候，才会严重影响人体的舒适度，出现胸闷，头晕等症状。因此，保持手术室内的湿度变化有利于降低细菌的存活率。
净化机的冷凝水盘的排水管道堵塞
1分析
由于常年没有进行维修，加上运行中的震动等客观原因，导致净化系统的有些管道的接口高于冷凝水盘的出水口，多余的液体不能正常的排出，导致净化系统机身内的湿度严重偏高，从而滋生大量细菌，在运行时会产生细菌、灰尘吸附等，导致净化机在产生新风时，机身内的细菌跟随新风一起进入手术室。
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